Имеется фильм на английском языке в двух частях (2 CD). К нему имеется звуковая дорожка в wav-файле. Подскажите пожалуйста, каким образом лучше совместить эту дорожку с фильмом (так, чтобы можно было смотреть фильм, загрузив оба файла (CD1 и CD2) в плейлист и подключив аудио-файл с переводом), если дорожка на несколько секунд рассинхронизирована с изображением?

Синхронизировать дорожку с фильмом. Т.е., сначала разрезать ее на две части, а потом каждую из них синхронизировать с соответствующей частью фильма. Потом можно наложить дорожку, например VirtualDub'ом, чтобы иметь готовый AVI.