Очень может быть что я ошибаюсь, это тока предположение.

dropped frame это такая гадость которая позволяет кодеру сбрасыват фреймы когда он считает нужным( битрейта не хватает, или изменения из кадра в кадр незначительны ), самое дурацкое, что почему-то в wmv это не заметно, а как только переводишь в avi начинает дергатся особенно на быстрых сценах. Такое впечатление что декодеры для avi и wmv обрабатывают dropped frame по разному. Для avi повторяет предыдущий фрейм, а wmv ... хрен его знает, что он там делает, но дерганья не видно. И как это лечить, не знаю.